El Programa fue diseñado para estudiantes que trabajan, que tienen vinculación institucional y que no pueden dedicarse exclusivamente al estudio. Ha sido, por tanto, concebido, como un Programa de apoyo a las instituciones para las cuales laboran los estudiantes ya que estas instituciones deberán otorgarle un permiso para realizar sus estudios. 

El plan de estudios contempla 7 ciclos (semestres) durante los que el estudiante podría finalizar su tesis de grado, dependiendo de su dedicación al estudio.

De los 100 créditos del plan de estudios, en que deberá matricularse, un estudiante puede acreditar hasta un máximo de 30 créditos por su experiencia en investigación y formación académica, de acuerdo con el análisis que de sus atestados realice la Comisión del Programa. En este caso la duración del programa puede ser menor. Cada semestre regular en la Universidad de Costa Rica tiene una duración de 16 semanas. 

El programa funciona mediante una modalidad compuesta por dos períodos de trabajo cada semestre:  un período grupal intensivo de formación y un período de trabajo individual de investigación. Durante cada ciclo o semestre, el estudiante deberá dedicar seis semanas a tiempo completo en la sede de la Universidad de Costa Rica al período grupal intensivo de formación.   Durante las diez semanas restantes, el estudiante deberá dedicarse individualmente a la realización de trabajos de investigación, en Costa Rica ó en su país de origen.  Durante este período de trabajo individual, deberá dedicar al menos medio tiempo al estudio, con lo cual, si su institución lo requiere podrá integrarse medio tiempo a su trabajo.  Obviamente, resulta ideal si el estudiante puede dedicarse exclusivamente a los estudios ya que de esta manera no sólo podrá profundizar más en sus trabajos de investigación sino que podrá terminar más rápidamente.

La comunicación entre profesores y estudiantes se mantiene mediante la utilización del correo electrónico y con ayuda de programas informáticos que facilitan la comunicación por vía electrónica.

El Programa también tiene como requisito realizar una pasantía de investigación de un semestre en una prestigiosa universidad extranjera, especialmente seleccionada de acuerdo con el tema de tesis y la metodología de investigación que esté trabajando el estudiante. 

Objetivos

1. Formar investigadores con un amplio dominio en el campo específico de la educación y de las ciencias sociales que le son afines. 
2. Preparar profesionales capaces de realizar, dirigir y difundir investigación relevante para la transformación y el mejoramiento educativo de la región. 
3. Promover niveles de excelencia en el conocimiento de los problemas educativos, en la producción científica y en el desempeño profesional. 
4. Proporcionar instrumentos teóricos y metodológicos para el análisis y la investigación de los problemas educativos. 
5. Generar conocimiento por medio de la investigación y el análisis de resultados del proceso educativo. 
6. Establecer un foro permanente de debate académico para el análisis y el desarrollo de distintos enfoques y orientaciones en la educación.